Você pode experimentar o Krusader ( link )
Felicidades.
Esta questão não é sobre o diff visual - isto é, comparação de arquivos.
Existe uma ferramenta que me permite comparar o diretório A e B (recursivamente), e como a saída eu teria dois painéis, com listas - arquivos em A (como lista linear, não uma árvore) que estão faltando em B e no segundo - arquivos em B que estão faltando em A. E então eu poderia selecionar alguns desses arquivos, copiá-los, removê-los, renomeá-los, etc.
A base de comparação no nome do arquivo e no tamanho do arquivo é suficiente para mim.
Existe uma ferramenta perfeita para essas necessidades, e é chamada de Komparator (não confunda com o Kompare) - ela vem com o ... KDE 3.5. Desde que eu tento migrar do KDE 3.5, eu estou procurando por algo "moderno".
Eu verifiquei o grsync, mas ele para diretórios de sincronização automática, menos para mostrar diferenças e operações manuais (a menos que eu sinta falta de algo).