Que tal apenas pegar a estrutura e recriá-la?
mkdir $( from=/copy/from;
to=/copy/it/here;
ssh -q [email protected] "find $from -type d" \
| sed "s=^$from/\?=$to/=" )
Eu usei sed
para remover o prefixo do caminho absoluto e substituí-lo pelo prefixo. Teste com echo
em vez de mkdir
para ter certeza de que faz o que deseja.
Além disso, espero que você não use caracteres especiais em nomes de diretório.