Você pode se livrar do arquivo de autostart em /etc
:
rm /etc/xdg/autostart/orca-autostart.desktop
deve impedir que ele seja iniciado. Arquivos em / etc são para o administrador editar ou remover como ele / ela agrada, então isso não deve causar problemas (exceto, é claro, qualquer causado pelo orca não estar rodando).
Alternativamente, você pode desinstalar o meta-pacote gnome, mas manter todas as dependências exceto orca. No entanto, na atualização, você pode não ter uma instalação "completa" do GNOME se o GNOME adicionar pacotes adicionais.