Assumindo que k
na sua saída é um erro de digitação, aqui está uma maneira de fazer isso no bash
paste -d $'\n' <(cut -f1,2 -d' ' input.txt | tr -s $'\n' ' ') \
<(cut -f3,4 -d' ' input.txt | tr -s $'\n' ' ')
que produz
1 2 6 7 a b f g
3 4 8 9 c d h i
Solução baseada no GNU awk
awk '{for (j = 1; j <= NF; ++j) arr[NR,j] = $j};
END{
for (j=1; j <=NF; j+=2) for(i=1; i <=NR; ++i){
printf i == 1?"": " "; printf arr[i,j]" "arr[i,j+1];
if (i == NR) printf "\n"
}
}' input.txt