O PackageKit tem a capacidade de notificar quando um aplicativo, sessão ou sistema precisa ser reiniciado. Por algum motivo, o pacote do Google Chrome está fazendo com que o PackageKit notifique você de que sua sessão de login precisa ser reiniciada. Eu acho que o modo como o PackageKit gerencia esse tipo de coisa é o pior cenário, então assume que toda a sessão precisa ser reiniciada, não apenas o aplicativo. Talvez valha a pena enviar um relatório de erros ao Google sobre isso.