Não tenho certeza sobre o kdenlive, mas ao usar o Cinelerra, o tamanho máximo do arquivo era limitado apenas pelo sistema de arquivos (ou seja, o limite superior do ext3). Eu ficaria surpreso se você atingir qualquer limite, mas isso depende de como você divide seus clipes. link tem um pouco mais de informação, mas eu acho que sua RAM vai ter mais efeito do que qualquer limitação programática.
Se você está se referindo ao limite de janelas antigas de tamanhos de arquivo de 2GB, isso não está em vigor no linux.
Se você precisar dividir um grande arquivo VOB para prosessing, poderá usar o ffmpeg (mais detalhes aqui: link )