Eu tenho um arquivo semelhante a este; onde eu quero remover cada quarta linha contendo o termo POPEL e as linhas que não contêm o termo POPEL devem permanecer inalteradas. Existe algum comando shell que eu possa usar para conseguir o mesmo?
ATOM 35168 C310 POPEL 21 -55.342 50.172 277.202 1.00 0.00 L29 C
ATOM 35169 C311 POPEL 21 -54.573 48.982 277.883 1.00 0.00 L29 C
ATOM 35170 C312 POPEL 21 -55.514 47.942 278.341 1.00 0.00 L29 C
ATOM 35171 C313 POPEL 21 -54.925 46.686 279.024 1.00 0.00 L29 C
ATOM 35172 C314 POPEL 21 -55.997 45.711 279.545 1.00 0.00 L29 C
ATOM 35173 C315 POPEL 21 -55.353 44.401 280.101 1.00 0.00 L29 C
ATOM 35174 C316 POPEL 21 -56.243 43.664 281.090 1.00 0.00 L29 C
ATOM 53696 CA ARG A 17 -20.523 -12.601 204.054 1.00111.27 C
ATOM 53707 CA LEU A 18 -19.719 -8.859 204.177 1.00108.86 C
ATOM 53715 CA PRO A 19 -18.861 -6.764 207.199 1.00105.57 C
ATOM 53722 CA HIS A 20 -21.685 -4.738 208.657 1.00 92.98 C
ATOM 53732 CA PRO A 21 -23.472 -1.861 207.030 1.00 79.64 C
ATOM 53739 CA THR A 22 -22.732 0.531 209.838 1.00 69.21 C
ATOM 53746 CA LEU A 23 -19.126 -0.513 209.819 1.00 82.65 C
ATOM 53754 CA LEU A 24 -18.800 0.542 206.174 1.00 86.67 C
ATOM 53762 CA PHE A 25 -19.447 4.011 207.542 1.00 87.41 C
ATOM 53773 CA VAL A 26 -16.695 3.967 210.128 1.00 78.42 C
com o awk:
awk '(NR % 4) || !/POPEL/' input-file > output-file
A ação padrão no awk para uma condição verdadeira é imprimir a linha, então isso imprime a entrada quando:
NR % 4 não é zero, então tudo, exceto cada quarta linha POPEL . Usando o GNU sed :
sed -i.bak '0~4{/POPEL/d}' infile
exclua linhas contendo POPEL em todas as 4 linhas th somente.
de homem sed
first~step
Match every step'th line starting with line first. For example, ''sed -n 1~2p'' will print all the odd-numbered lines in the input stream, and the address 2~5 will match every fifth line, starting with the second. first can be zero; in this case, sed operates as if it were equal to step. (This is an extension.)
Tags grep text-processing awk sed