Eu assumo que é disso que você está falando?
Próximo ao topo do Centro de Software, há uma barra com "Todos os softwares, instalados e históricos" Quando você tem uma instalação funcionando, há também um Em andamento à direita do Histórico
Clique na guia Em andamento e você verá o Matlab com a barra de progresso, ao lado da barra de progresso haverá um X se você clicar no X ele cancelará a instalação.
Se você já o instalou, não poderá cancelá-lo, mas poderá removê-lo completamente do seu sistema. A maneira mais fácil de se livrar dele completamente seria em um terminal, digite este comando
sudo apt-get purge matlab-support