Assumindo que você não se importa em tentar definir propriedades em arquivos que já as possuem corretamente, eu acho que você poderia executar algo nos moldes de
/bin/stat --format 'chown %u:%g %n' ~/.bash*
no servidor A, que lhe dará uma lista de comandos chown
para executar no servidor B. (Você pode canalizar tudo por | ssh user@serverB
.)
Você receberá o erro ocasional de arquivos que não existem em B, mas isso seria inofensivo.