Eu acho que ninguém fora da Canonical pode responder com autoridade, e uma resposta não seria produtiva de qualquer maneira.
Se você quiser saber como usar as versões recentes do avidemux no xenial, existem vários PPAs ao redor.
O ppa de Thanh Tung Nguyen parece ser de boa qualidade, mas infelizmente, a última versão não conseguiu construir. Há também um getdeb.net ppa que é especializado em software obscuro, e tem o mais recente avidemux 2.6.12. Você precisa instalar a versão avidemux2.6-qt ou a versão avidemux2.6-cli . Para mim, funciona sem problemas.