Crie um novo grupo com gid específico. Você pode fazer isso com groupadd :
groupadd -G 999 mygroup
Uma pergunta alternativa, mas menos geral, seria: Como usar groupmod com base em um id de grupo?
man groupmod indica que um grupo só pode ser pesquisado pelo nome do grupo. Este é aparentemente um problema para grupos que só têm um id e não um nome, veja o grupo com id == 999 abaixo:
~$ id
uid=1000(brandon) gid=1000(brandon) groups=1000(brandon),999
Crie um novo grupo com gid específico. Você pode fazer isso com groupadd :
groupadd -G 999 mygroup