Não sei muito bem quais são as diferentes partições do Windows, por isso não posso aconselhar muito sobre o que há em cada uma delas. Mas se você quiser apenas apagar / sobrescrever algumas partições que não são usadas para Lubuntu, você pode usar gparted e você deve ser capaz de editar / apagar partições que não são usadas pela sua instalação do Lubuntu. A execução de um dvd / usb ao vivo permite que você edite qualquer uma das partições do HD, já que ele é executado apenas no dvd / usb.
Sempre que você alterar / editar / excluir as partições do disco rígido, haverá um risco de perda de dados, por isso, ter sempre um bom backup de dados importantes primeiro é sempre uma boa ideia.
Se você perdeu seu GRUB de excluir algumas partições, você deve manter um bom live dvd / usb à mão e você sempre pode executar o Utilitário" Boot Repair ", ele deve ser capaz de reinstalar o GRUB caso ele tenha sido excluído.