Esta não é realmente uma resposta para o problema, mas um truque rápido:
altere o conjunto de cores usado pelo gedit nas preferências. Em alguns conjuntos, o cinza claro é claramente visível.
Eu atualizei para o Ubuntu 14.10 hoje, e em sua versão do gedit (3.10.4), o plugin de verificação ortográfica destaca palavras com erros ortográficos em cinza claro. Existe uma maneira de mudá-lo de volta para vermelho? Eu dei uma olhada no Editor de Esquemas de Cores e não consegui encontrar um estilo correspondente.
Esta não é realmente uma resposta para o problema, mas um truque rápido:
altere o conjunto de cores usado pelo gedit nas preferências. Em alguns conjuntos, o cinza claro é claramente visível.