O problema é que o debootstrap não usa seus chaveiros locais em /etc/apt/trusted.gpg
ou /etc/apt/trusted.gpg.d/
, mas usa apenas os chaveiros em /usr/share/keyrings/
.
Do Debian 8 Jessie em diante, você pode simplesmente instalar o pacote (oficial Debian) ubuntu-archive-keyring e deve corrigir o seu problema.
Em versões anteriores do Debian, você poderia fazer pbuilder passar --keyring=/etc/apt/trusted.gpg
para o debootstrap já que você tem a chave correta no arquivo. Adicionar --debootstrapopts --keyring=/etc/apt/trusted.gpg
à chamada do pbuilder deve fazer isso de acordo com a página man.