O problema é que o debootstrap não usa seus chaveiros locais em /etc/apt/trusted.gpg ou /etc/apt/trusted.gpg.d/ , mas usa apenas os chaveiros em /usr/share/keyrings/ .
Do Debian 8 Jessie em diante, você pode simplesmente instalar o pacote (oficial Debian) ubuntu-archive-keyring e deve corrigir o seu problema.
Em versões anteriores do Debian, você poderia fazer pbuilder passar --keyring=/etc/apt/trusted.gpg para o debootstrap já que você tem a chave correta no arquivo. Adicionar --debootstrapopts --keyring=/etc/apt/trusted.gpg à chamada do pbuilder deve fazer isso de acordo com a página man.