Você precisa usar gpart (não gparted) para criar partições e, em seguida, colocar um sistema de arquivos na nova partição usando newfs . Em seguida, use dump | restore ou rsync para copiar os dados para o novo disco. Por fim, use gpart para garantir que haja um código de inicialização na unidade. Veja as man pages para estes comandos para mais detalhes.
Uma observação, porém, dada a pergunta, acredito que o SO não tenha sido atualizado desde 2004 e não é mais suportado e não recebe atualizações de segurança. Então, na verdade, é melhor instalar um novo sistema no novo disco e usar dump | restore ou rsync ou cp para copiar manualmente os dados relevantes para o novo disco. Eu não recomendo colocar o sistema operacional de 2004 de volta em produção.