Eu descobri o que estava acontecendo.
Eu tinha o applet 'Multi-core System Monitor' instalado e adicionado a uma das minhas barras de tarefas. Parece que há um bug nesse código que faz com que o polkitd tenha uma tonelada de uso da CPU que aumenta constantemente ao longo do tempo para níveis não razoáveis.
Mais informações sobre o applet causa o aumento contínuo do uso da memória