Se você quiser concatenar o conteúdo do arquivo, poderá fazer isso
cat dir*/file1 > file1
cat dir*/file2 > file2
cat dir*/file3 > file3
O curinga fará o comando cat ler o conteúdo de todos os dirs / files correspondentes ao padrão, assim você obterá o conteúdo dos arquivos com o mesmo nome em todos os três diretórios gravados no arquivo resultante.