Se o item folder1 for realmente o arquivo file1 , não haverá diretório folder1 preexistente. O comportamento padrão de cp é que, se o destino for um diretório, os itens a serem copiados serão copiados para o diretório de destino. Note que no Linux, folder1 e Folder1 são diferentes, como é sensível a maiúsculas e minúsculas.