Recebi uma mensagem semelhante a isso há um tempo atrás. Descobriu que era um problema de hardware com a forma como as interrupções foram passadas do controlador PCI para o controlador PCI-Express (chipset Intel PCI6466). Verifique mais profundamente nos logs, procure:
irq 43: nobody cared (try booting with the "irqpoll" option)
Existem várias coisas que podem causar isso, incluindo drivers incorretos.