Veja esses problemas ( # 27- Tamanho e deslocamento & # 35 - Permitir várias instâncias do omxplayer em execução ) no website de desenvolvedores do omxplayer .
Parece que esse recurso está sendo desenvolvido ativamente. Você pode ter alguma sorte baixando a versão mais recente do desenvolvimento e referindo-se a esses dois segmentos, especificamente # 27. Há muitas informações sobre como tornar a versão mais recente de omxplayer
funcionando com esse recurso ativado.