Sim, você pode e, dependendo da sua distribuição, deve funcionar imediatamente. Pelo menos com drivers de código aberto. Eu não sabia se os drivers de código fechado se comportariam de maneira estranha, mas não deveriam.
No entanto, o Xinerama não é mais o que você quer fazer. A extensão Randr cuida de monitores aranging. Você pode usar ferramentas como arandr
para alinhar suas telas usando uma GUI.