opção a)
- instale e copie seus arquivos pessoais / restaure os pacotes instalados
opção b)
- salve sua chave de criptografia de disco da instalação antiga
- inicializa a partir do CD / USB (eu usaria a mídia de instalação do ubuntu, porque lá você pode instalar todas as ferramentas que faltam)
- clone partition 1 e 2
- crie a nova seção com cryptsetup / zuluCrypt usando a chave antiga
- monte as duas partições criptografadas
- clone arquivos de sda3 para o novo disco usando o rsync.