Parece que seu /usr/bin/make foi ao menos parcialmente substituído por outra coisa. Isso pode significar que você tem alguma corrupção no sistema de arquivos. Quais tipos de sistema de arquivos você está usando?
Você pode querer executar uma verificação completa do sistema de arquivos para ver se há mais corrupção no sistema de arquivos do que apenas um /usr/bin/make sobrescrito. Se você estiver usando o XFS, deve estar ciente de que os comandos genéricos fsck ou fsck.xfs não fazem nada para sistemas de arquivos XFS, já que esse tipo de sistema de arquivos deve fazer todas as verificações de rotina internamente . Para apenas verificar erros em um sistema de arquivos XFS, você deve usar xfs_repair -n . Como sempre, as verificações do sistema de arquivos devem ser executadas com o sistema de arquivos em questão desmontado ou montadas como somente leitura se for seu sistema de arquivos raiz.