Não tenho certeza do que você quer dizer.
Mas dado um diretório
$ ls
bar.txt foo.abc foo.txt
$
Você pode classificar apenas o nome, retirando a extensão, conforme abaixo
$ find . -type f | sort -k 2,2 -t. -u
./bar.txt
./foo.txt
$
Como sempre, um exemplo de entrada junto com a saída desejada ajudaria muito.