Eu tenho o mesmo problema, embora meu ipod touch NÃO tenha sido redefinido recentemente (que eu saiba, eu comprei de segunda mão).
Você instalou libimobiledevice a partir do centro de software do Ubuntu? Isso permitiu ao ubuntu 14.04 ver meu dispositivo ipod touch (ele aparece como um ícone no menu vertical do lado esquerdo e no gerenciador de arquivos), mas NÃO para ver os arquivos ainda. Mais trabalho para fazer.
É surpreendente que não haja nenhum feedback para o libimobiledevice no centro de software do ubuntu ...