Posso confirmar que a combinação Deja-Dup / Duplicity apenas torna o processo de backup atrozmente lento (~ 156x mais lento, na verdade).
Acabei limpando o backup do Deja-Dup / Duplicity e usei o rsync puro. Os backups estão demorando apenas 15 segundos.
$ rsync -a --delete /home/tim /media/tim/BackupDrive/
A menos que você realmente, realmente precise da simplicidade que o Deja-Dup oferece ou dos recursos que o Duplicity oferece, então não se preocupe - você está apenas desperdiçando ciclos de CPU, tempo, eletricidade, causando desgaste desnecessário em sua unidade e você terá um backup frágil. Deja-Dup / Duplicity é uma maneira ineficiente de simplesmente fazer backup de arquivos de uma unidade local para outra.
Para backups simples, automatizados e locais, tudo o que você precisa é adicionar uma entrada rsync ao seu crontab.