Eu tive uma dor de cabeça tentando instalar o Cuda 6.0 no Ubuntu 14.04. Depois de procurar por soluções, cheguei à conclusão de que o cuda6 não roda no Ubuntu 14.04. A versão disponível para o Ubuntu 14.04 está ficando para trás do kit de ferramentas NVIDIA CUDA 6.
Você poderia tentar: Instalando e testando o CUDA no Ubuntu 14.04
Eu instalei o Cuda 5.5 no Ubuntu 14.04 e ele funciona bem. Eu tenho o driver nvidia 331 instalado.
Eu acho que você instalou o Cuda 5.5 no Ubuntu 14.04. Parece funcionar melhor que Cuda6.