A habilidade vem com muita prática, você deve usar o Linux constantemente e com o tempo você vai ficar melhor. Comece lendo a página do manual de qualquer comando que você usa, mesmo que você saiba o básico disso, por exemplo: ls todo mundo usou, mas muitos não entendem o que ele faz e como. Apenas leia e pratique também um livro obrigatório para ler este um .