A maneira de lidar com isso é escrever seu próprio arquivo xorg.conf (ou colocar um arquivo no subdiretório em que xorg.conf partes são coletadas, se a sua distribuição o fizer dessa maneira) e usar a seção InputClass para combine seu dispositivo usando ID de fornecedor e dispositivo ou outros identificadores de hardware e, em seguida, aplique as opções InputDevice que também são válidas para a seção InputClass para ativar o toque no touchpad ou o que você deseja configurar.
Cuidado, os nomes das opções podem ser ligeiramente diferentes dos nomes xinput , portanto, observe de perto. Inspecione /var/log/Xorg.0.log após (re) iniciar o servidor X para ver se funcionou.
Veja man xorg.conf para opções, ou google para tutoriais (deve haver alguns).