Não, em teoria, a reinstalação do coreutils não deve ser perigosa e, sim, deve trazer de volta env
.
No entanto, eu ficaria mais preocupado com o fato de estar faltando, em primeiro lugar. Se você tem certeza de que não mudou nada e este é um servidor web, presumivelmente, aberto à internet, você quer verificar se o seu sistema pode ter sido comprometido.