Reconfigure X :
Xorg -configure
ele irá gerar um novo arquivo xorg.conf.new , copie para /etc/X11/xorg.conf :
cp xorg.conf.new /etc/X11/xorg.conf
Você pode criar e configurar /etc/X11/xorg.conf.d/20-nvidia.conf manualmente sem usar nvidia-xconfig ; e, g:
#/etc/X11/xorg.conf.d/20-nvidia.conf
Section "Device"
Identifier "My GPU"
Driver "nvidia"
EndSection
Ou use o seguinte comando para criá-lo:
mkdir /etc/X11/xorg.conf.d
echo -e 'Section "Device"\n\tIdentifier "My GPU"\n\tDriver "nvidia"\nEndSection' > /etc/X11/xorg.conf.d/20-nvidia.conf