Na prática, eles serão efetivamente usados como duas unidades separadas por padrão, como no Windows, como você afirma.
Por exemplo, se / dev / sda1 tiver 50MB livres e / dev / sda2 tiver 50MB livres e você tentar escrever um arquivo de 75MB para qualquer um deles, ele falhará com um erro de disco cheio apesar de ambas as partições serem divisões do mesmo disco.