/etc/security/access.conf é consultado apenas pelo módulo pam_access.so , que não está habilitado na configuração do estoque PAM no Debian. Uncomment o
account required pam_access.so
linha em /etc/pam.d/login (ou onde quer que você queira usá-lo). Você não precisa reiniciar nada, ele entra em vigor imediatamente.