Você pode iniciar um programa usando cpulimit
com a sintaxe cpulimit -l limit -- program
, então é necessário fazer isso:
cpulimit -l 5 -- java -a dsasda -p adss
cpulimit -l 5 -- java -a dsasad -p adds
...
(edite: se você também precisa do nohup
você precisa rodar também, é claro: nohup cpulimit -l 5 -- java -a ...
)