O cd
não deve ser obrigatório. A linha a seguir deve fazer o mesmo.
/WebSphere/was85/mycel/mynode/AppServer/java_1.7_64/bin/java -cp \
/usr/my.jar com/com.my_comapny_witt_entire_name/myMain
Eu quebrei a linha de comando em duas linhas usando a continuação da contrabarra. Não deve haver caracteres entre a barra invertida e a nova linha para continuação do trabalho.
Uma alternativa é incluir o diretório bin Java na variável PATH, antes de qualquer diretório que contenha java. O comando which java
deve informar qual java será usado.
PATH=/WebSphere/was85/mycel/mynode/AppServer/java_1.7_64/bin:$PATH
java -cp /usr/my.jar com/com.my_comapny_witt_entire_name/myMain