ssh remote_host "sed -i -e 's/12.1.0.11/#12.1.0.11/g' -e 's/12.1.0.12/#12.1.0.12/g' -e 's/12.1.0.21/#12.1.0.21/g' -e's/12.1.0.22/#12.1.0.22/g' /etc/hosts"
Tenho certeza que você pode curinga esses valores, mas lidar com regex em conexões remotas não é minha idéia de diversão, pois pode exigir muitos caracteres de escape e ficar fora de controle rapidamente