As dependências padrão do pacote owncloud no Debian incluem o php mysql binding e o apache, mas existem alternativas para o sqlite e outros servidores web.
Se você fizer isso:
apt install owncloud php5-sqlite nginx apache2-
então apt notará que você está instalando o pacote nginx e php5-sqlite , decida que eles satisfazem as dependências do pacote owncloud , e não puxe o mysql ou apache2.
Infelizmente, algo ainda está no apache, então adicionamos uma instrução explícita ao apt que não deveria fazer isso, com o apache2- bit. Observe o traço ("-") no final; que diz ao apt para remover um pacote, ou para não instalá-lo se ainda não tiver sido instalado.
Alternativamente, você também pode instalar o nginx e o php5-sqlite primeiro, configurá-los (se necessário), e somente então (depois de ter feito isso) instale o owncloud pacote.