Isso costumava me confundir também. Eu finalmente percebi que deveria escolher um e apenas um sistema para o grub ser configurado. Depois que fiz isso, foi um pedaço de bolo. Instale um novo Linux, tente fazer com que ele não instale o grub (e, se assim for, apague-o), então vá para o sistema Linux de controle e execute update-grub ou grub-mkconfig (dependendo da distribuição).