Eu não entendo o que você está realmente perguntando, mas a resposta é provavelmente:
Não deve haver diferença entre os sistemas de arquivos . Syscalls e VFS são agnósticos em sistemas de arquivos. O padrão POSIX define a maior parte do que as operações de arquivos fazem, no que diz respeito a stat fields, definindo assim quando e como os campos semelhantes a atime são atualizados. Dito isso, os sistemas de arquivos têm suas próprias peculiaridades, mas provavelmente não são o que você pergunta.