O glxgear não é uma boa ferramenta para o benchmarking da GPU. Ele praticamente não contém nenhum trabalho para a GPU, portanto, a maior parte do que está sendo medido é o trabalho da CPU e a comunicação da GPU com a CPU. E o último será melhor para a Intel, já que o CPU e o GPU estão no mesmo chip.
Tente algum jogo exigente ou um benchmark adequado.