Você precisa entender duas coisas no F22:
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dnf não auto-atualiza seu cache como o yum, na verdade ele fica fora do seu jeito de mentir para você algumas vezes. Isso significa que, como o apt, você realmente precisa executar:
dnf clean expire-cache && dnf upgrade
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No F22, a área de trabalho não usa mais o mesmo gerenciador de pacotes que a linha de comando. Eles estão usando o mesmo depsolver e, na maioria das vezes, olhando os mesmos dados, portanto, se os repodados corresponderem, eles devem mostrar os mesmos resultados. Mas não se confunda se eles não o fizerem, isso é apenas o novo normal.