Não está disponível como parte do Unix padrão ou de uma interface gráfica do Linux.
Os administradores do sistema Linux podem usar o overlayfs. Na verdade, um dos usos mais importantes é permitir modificações em um sistema LiveCD em execução, por exemplo, instalar pacotes extras.
Existem também equivalentes no FUSE, que podem ser usados no Linux sem privilégios de root. Haverá limitações adicionais do FUSE, mas poderia funcionar bem para os mesmos casos que os recursos que você mencionou. O unionfs-fuse parece estar disponível no Ubuntu. ("union mount" é um termo mais antigo para o conceito).