Um antigo documento da FSF sugere que o Ubuntu instale um loader (GRUB) assinado com sua própria chave, sem link para a Microsoft. A mídia de instalação depende da chave usual da Microsoft. [1] [2]
Isso implica que o processo de instalação do Ubuntu carrega a chave do Ubuntu no seu UEFI.
Então, talvez eu tenha limpado as chaves UEFI em algum momento, e então o Ubuntu (talvez seu disco de instalação) restaurou a chave do Ubuntu, mas não a Microsoft.
Não tenho 100% de certeza. Não estou executando mais testes.
[1] aparentemente não é possível ter um carregador de boot assinado usando duas chaves diferentes, ou seja, a chave do Ubuntu e da Microsoft ao mesmo tempo.
[2] e se você está se perguntando por que eles fazem isso - eu não sei exatamente, mas aparentemente o Ubuntu quer que o hardware certificado para Ubuntu também inclua as chaves do Ubuntu. Isso permitiria que você removesse a chave da Microsoft e ainda inicializasse sua instalação do Ubuntu (quando / se você usar um disco de recuperação genérico, você teria que desabilitar a inicialização segura).