Se durante a inicialização você fechar rapidamente a guia que diz "Mais visitados", eu consegui executar o Epiphany sem problemas. Quando o meu começa, ele tenta abrir duas abas; "Mais visitados" e uma guia chamada "Página em branco". Você tem que esperar até que ambas as guias estejam visíveis e, em seguida, feche a guia "Mais visitados" o mais rápido possível. Às vezes, leva várias tentativas.
Não tenho certeza do que isso nos diz, mas não comecei a ter problemas até fazer o upgrade de Wheezy para Jessie. Agora que sei o que fazer, posso começar sem muita dificuldade.