Use o PSFTP, que faz parte da instalação do PUTTY (PSFTP.EXE na mesma pasta).
Basta digitar sftp <your_machine_ip> e usar os comandos FTP padrão para copiar / colar arquivos entre hosts ( put <local_file> para upload, get <remote_file> para download, etc.).
Mas se você quiser se conectar a uma unidade compartilhada, provavelmente precisará usar o cliente samba assim:
smbclient //computer_name/share_name -U <your_windows_user>