Além das sugestões da Dylan para começar de novo, outra opção não intrusiva é mover algum material da partição raiz para a partição dos diretórios base. Você deve fazer isso apenas para material que não seja de inicialização crítica, mas há muito disso em / fora de /home .
Meu primeiro Unix até tinha partições separadas para /usr e /var .
Você pode copiar, por exemplo tudo de /usr/share a /home/ROOT/usr/share as root :
cd /usr/share
find . -print0 | cpio -pdmv0 /home/ROOT/usr/share
e uma vez terminado corretamente:
cd /usr
rm -rf share
ln -s /home/ROOT/usr/share .
O material recém-instalado que entra em /usr/share terminará na partição /home . É claro que você pode fazer vários subdiretórios de / dessa forma, ou obter um bloco maior fazendo um que seja mais alto na hierarquia.
Contanto que você não "mova" /boot desta forma, você deve estar bem.