Em um diretório específico, eu tenho alguns arquivos. Se eu quiser verificar o tamanho dos arquivos, eu uso o comando ls-lh nesse diretório e recebo isso como saída:
total 61G
-rw-r--r--+ 1 user user 81 Dec 18 11:50:00 AM sra.o6691673
-rw-r--r--+ 1 user user 81 Dec 18 12:16:00 PM sra.o6691674
-rw-r--r--+ 1 user user 67G Dec 18 11:50:00 AM SRR531824_1.fastq
-rw-r--r--+ 1 user user 73G Dec 18 12:16:00 PM SRR531825_1.fastq
Antes de tudo, o total diz 61G e eu tenho 2 arquivos que já são 67G e 73G cada, então como é calculado o total ??
Em segundo lugar eu usei o comando
du -sh *
no mesmo diretório e obteve isso como resultado
1.5K sra.o6691673
1.5K sra.o6691674
30G SRR531824_1.fastq
32G SRR531825_1.fastq
Qual é o tamanho real dos arquivos e o que devo levar em consideração ls-lh ou du -sh *.
Espero que os arquivos tenham mais espaço alocado no disco do que eles estão realmente usando. Normalmente eu esperaria ver isso apenas em arquivos binários, onde os blocos de NULLs não são armazenados. Como o formato fastq é o texto, acho que a alocação de arquivos ultrapassa o final dos dados. Experimente o comando ls -lsh e compare os dois tamanhos listados para cada arquivo. A coluna 1 é a quantidade de espaço em disco alocada e a coluna 6 é o espaço em disco usado.