Se os seus scripts de inicialização suportarem, você pode adicionar -c -c a /fsckoptions (então crie /forcefsck e reinicialize). Infelizmente, esse recurso não está disponível em todos os lugares. Você provavelmente terá que reinicializar para um LiveCD / LiveUSB.
Realize varreduras de blocos danificados na partição raiz no Linux