Na minha experiência ao lidar com a mudança de um repo para outro para um determinado pacote, é quase sempre mais fácil fazer a instalação do repositório atual e depois fazer uma instalação do pacote usando o novo repositório.
Isso geralmente leva a todos os tipos de problemas, que são muito mais trabalhosos do que lidar com a etapa de desinstalação / reinstalação.
OBSERVAÇÃO: eu sugeriria coletar qualquer um dos arquivos relevantes que pertencem à instalação atual antes de tentar isso. Por exemplo, se for um banco de dados, eu criaria um diretório no qual eu manteria cópias de qualquer um dos arquivos em /etc
ou /var
, por exemplo ', e manteria os arquivos lá como referência enquanto você re-configura o novo pacote do novo repo.