Se você quiser, por exemplo, verificar md5sum para todos os arquivos em / bin, você pode:
- monte você / bin dir da máquina quebrada na máquina boa e execute uma verificação com executáveis na máquina boa.
Exemplo:
for i in 'ls /mounted/bin'
do
md5sum /bin/$i >> broken.txt
done
for i in 'ls /bin'
do
md5sum /bin/$i >> good.txt
done
cmp broken.txt good.txt
Mas não tenho certeza de que isso é o que você está pedindo ....